1985
Pada tahun 1985, ketika almarhum K.H. Imam Zarkasyi (Trimurti termuda) wafat, Institut Pendidikan Darussalam (IPD) belum dapat ditingkatkan menjadi universitas, meskipun telah secara rutin meluluskan alumninya.
Kemudian pada tahun 1994, IPD ditingkatkan menjadi Institut Studi Islam Darussalam (ISID), seiring dengan dibukanya Fakultas Syariah sebagai fakultas baru. Dua tahun kemudian, pada tahun 1996, institut ini memperluas kampusnya ke lokasi baru di Siman, Ponorogo, sehingga memungkinkan pengelolaan pendidikan yang lebih intensif dan mandiri.
Selanjutnya, pada tahun 2010, ISID mulai merintis program pascasarjana, dan berbagai program studi dari sejumlah fakultas terus dibuka dan dikembangkan sesuai dengan standar akreditasi nasional.